Vítor Gonçalves é licenciado em Biologia pela Universidade do Porto (1991) e Doutor em Biologia pela Universidade dos Açores (2008), onde é atualmente Professor Associado na Faculdade de Ciências e Tecnologia. É coordenador do Grupo de Investigação em Ecologia das Águas Interiores (FRESCO) do CIBIO Açores e o responsável pelo Banco de Algas e Cianobactérias dos Açores (BACA).
Os seus principais interesses de investigação são a biodiversidade dulçaquicola, a taxonomia, ecologia e conservação de microalgas, e a avaliação do estado e evolução dos ecossistemas aquáticos. Também tem interesse nas aplicações biotecnológicas das microalgas e cianobactérias.
Participou em vários projectos de investigação e prestações de serviço, nas áreas da biodiversidade e ecologia aquáticas, monitorização da qualidade de ecossistemas aquáticos, e elaboração de planos estratégicos e de ordenamento de recursos hídricos. É autor de mais de 90 publicações entre livros, capítulos de livros, artigos em revistas cientificas, atas de encontros científicos e relatórios técnicos.
Participou em numerosos congressos e outras reuniões científicas, tanto nacionais como internacionais, onde apresentou mais de 50 comunicações (orais e posters). Possui uma vasta experiência letiva em biologia e diversidade de algas e fungos, e em ecologia aquática, tendo orientado inúmeros alunos de licenciatura, mestrado e doutoramento.